HU bioinfo launcher
HU bioinfo launcher は、統一された R および Python 開発環境を提供する解析用の VSCode 拡張機能です。Docker コンテナを用いて、一貫性のある開発環境をセットアップし、ユーザーに提供します。
機能
- 統一された開発環境: R と Python の統一環境を Docker コンテナで提供
- 簡単なセットアップ: VSCode の UI を通じて簡単に環境構築が可能
- キャッシュ共有: ライブラリやパッケージなどをキャッシュとして共有可能
システム要件
- サポートされている OS: Linux, macOS
- Windows 対応: WSL(Windows Subsystem for Linux)経由で使用可能
- 事前要件:
- Docker がインストールされていること
- Dev Container エクステンションがインストールされていること
基本的な使い方
- コマンドパレットから
bioinfo-launcher: Start bioinfo-launcher を実行
- 作業環境ディレクトリとGitHub PATを設定
- 環境構築後、コンテナ内でVS Codeが開き作業開始
ディレクトリ構造
選択した親ディレクトリ/
├── cache/ # キャッシュディレクトリ
└── container/ # コンテナ設定とプロジェクト
詳細情報
詳細な情報は以下のドキュメントを参照してください:
License
MIT License
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